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节点 n38

速度耦合的型内径向坐标微位移（σ阈0.55、δ=0.03×RMS、幅度∝s_t/s_max、位移后保锚RMS）：过门细胞型按转录速度幅度做型内凝聚，锐化区室边界；表达侧逐位不动，形状/邻域组齐升。

方法说明?节点程序自带的 METHOD.md：这个程序做了什么、为什么。

来自 programs.git 278bc0030c:solution/METHOD.md

调研员的计划

代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别：绿色是新增，红色是删除。

对比：父节点版本 9f2333113a。改动的文件：solution/METHOD.md +77 −110、solution/README.md +21 −17、solution/run.py +206 −86

diff --git a/solution/METHOD.md b/solution/METHOD.mdindex f8c275c..a7d344f 100644--- a/solution/METHOD.md+++ b/solution/METHOD.md@@ -1,110 +1,77 @@-基因级跨型符号一致性加权（xt50n）：过门基因按跨细胞型符号一致比例 u_g 重分配位移幅度（配对比重归一、保总位移），叠加父底物 lin50n/α=1.7/精确守恒；PLAN 的几何再闭合经 12 配置网格证否，提交此备选机制。--- family_id: T2HX-01-- 父节点: 34（A 半锚 56.599，本会话实测复现）-- 提交态 A 半（proxy_noscale）: **56.612**（expr 58.50 / cell 58.79 / local 59.16 / shape 50.00）-- ablate 态 = 父节点 34 提交态逐位（A 半 56.599）→ 机制隔离干净--## 1. 提交的方法--底物全部承自父节点 34（不变）：rel 速度 v=(m_a−m_p)/(m_p+1)（型内 log1p 均值），硬门控-（每型每阶段 ≥30 细胞、两阶段 pb ≥0.05、|v|≤2），软阈值 k=0.5，ε=0.4 两步支撑掩码扩散基座-（逐基因列缩放精确复原伪批量），型内 lin50n 方向一致性加权，α=1.7 乘法解码，逐细胞线性总量-精确回拉 γ=1.0（CP10k 守恒），PBC=10 亮度钳制；坐标 / 组成 / 行序 / 细胞数冻结（shape 组-结构性地板）。--**新机制 xt50n（基因级跨型符号一致性加权）**：lin50n 之后、解码之前，对每个过门基因 g，-u_g = 该基因的过门细胞型中速度符号与跨型多数符号一致的比例；所有 (型,基因) 对乘-w_g = 0.5+0.5·u_g，再除以配对比重的均值（总位移幅度守恒的纯重分配）。生物学依据：真实发育-程序（信号通路驱动的 TF 级联、谱系推进）让同一基因在多个谱系同向移动，而单型特异的伪批量-速度差由两个均值的抽样噪声主导；跨型符号一致性是从视图输入现场计算的可靠性代理（与-lin50n 的型内跨基因一致性正交，二者复合）。来源：Davidson & Levin 2005, Gene regulatory-networks, PNAS 102(14):4935, DOI: 10.1073/pnas.0408031102（发育 GRN 协调驱动跨谱系的基因-电池；通用机制知识，不涉及任何保留阶段的测量值）。实测：178 个过门基因，u_mean=0.974，-w∈[0.765, 1.020]——重分配幅度小，A 半 +0.013（噪声内，如实声明）。--`--ablate mechanism`：cons_g=none 且回退 renorm=cell/γ=1.0（=父节点解码），输出逐位等于-父节点 34 提交态。--## 2. PLAN（几何再闭合）证否记录 — 全部 20 次查分--PLAN 机制：把逐细胞精确守恒换成 s_i=(r_med/r_i)^γ_geo（r_i=T1_i/T0_i，r_med=中位数）。-第一轮 γ_geo×ε 网格（α=1.7、k=0.5、lin50n 固定），A 半 avg4 与各分项 points：--| γ_geo | ε | avg4 | expr | cell | local | de_score raw/pts | de_dir raw/pts | mmd_u raw/pts | vario raw/pts | nbhd raw/pts |-|---|---|---:|---:|---:|---:|---|---|---|---|---|-| 锚(cell γ=1.0) | 0.4 | 56.599 | 58.48 | 58.82 | 59.10 | —* | —* | —* | —* | —* |-| 1.0 | 0.1 | 56.535 | 58.43 | 58.81 | 58.90 | 0.1806/6.91 | 0.3738/7.70 | 0.04767/6.89 | 0.03542/7.81 | 0.07994/14.73 |-| 1.0 | 0.2 | 56.610 | 58.48 | 58.83 | 59.13 | 0.1806/6.91 | 0.3767/7.71 | 0.04756/6.90 | 0.03542/7.81 | 0.07919/14.78 |-| 1.0 | 0.4 | 56.623 | 58.53 | 58.85 | 59.11 | 0.1806/6.91 | 0.3790/7.72 | 0.04734/6.91 | 0.03554/7.80 | 0.07925/14.78 |-| 1.2 | 0.1 | 56.485 | 58.40 | 58.86 | 58.68 | 0.1806/6.91 | 0.3720/7.69 | 0.04911/6.80 | 0.03419/7.92 | 0.08067/14.67 |-| 1.2 | 0.2 | 56.550 | 58.44 | 58.88 | 58.88 | 0.1806/6.91 | 0.3745/7.70 | 0.04907/6.80 | 0.03415/7.92 | 0.08001/14.72 |-| 1.2 | 0.4 | 56.612 | 58.71 | 58.91 | 58.83 | 0.1944/6.97 | 0.3768/7.71 | 0.04896/6.81 | 0.03415/7.92 | 0.08015/14.71 |-| 1.35 | 0.1 | 56.373 | 58.19 | 58.82 | 58.48 | 0.1667/6.86 | 0.3728/7.69 | 0.05017/6.73 | 0.03355/7.97 | 0.08134/14.62 |-| 1.35 | 0.2 | 56.375 | 58.00 | 58.84 | 58.66 | 0.1528/6.80 | 0.3747/7.70 | 0.05017/6.73 | 0.03348/7.98 | 0.08074/14.67 |-| 1.35 | 0.4 | 56.350 | 57.96 | 58.86 | 58.58 | 0.1528/6.80 | 0.3723/7.69 | 0.05014/6.73 | 0.03345/7.98 | 0.08099/14.65 |-| 1.5 | 0.1 | 56.145 | 57.59 | 58.73 | 58.26 | 0.1389/6.75 | 0.3643/7.65 | 0.05118/6.67 | 0.03308/8.01 | 0.08208/14.57 |-| 1.5 | 0.2 | 56.210 | 57.67 | 58.75 | 58.42 | 0.1389/6.75 | 0.3684/7.67 | 0.05124/6.67 | 0.03299/8.02 | 0.08154/14.61 |-| 1.5 | 0.4 | 56.188 | 57.68 | 58.76 | 58.31 | 0.1389/6.75 | 0.3692/7.67 | 0.05126/6.66 | 0.03295/8.03 | 0.08189/14.58 |--（网格与备选行均为本会话 vec-score 原始输出。* 锚行当次只记录了组分；其 B 半官方分项见父节点-变化量表：de_score 0.1944、de_dir 0.3744、mmd_u 0.04631、vario 0.03486、nbhd 0.07595。A/B 半-raw 不可直接互比，下文所有比较均只在 A 半内部进行。）--结论：**证否**。de_score raw 随 γ_geo 上升整体下降（1/72 命中量化：γ=1.0 全为 0.1806=13 命中，-γ=1.2 为 0.1806/0.1806/0.1944，γ=1.35 为 0.1667/0.1528/0.1528，γ=1.5 全为 0.1389=10 命中），-expr 组 58.48→57.68；仅 variogram 单调改善（pts 7.80→8.03）。PLAN 预期 γ_geo 上升带来-de_score 上升（node 33 的 0.1944→0.2639），本底物上方向相反。PLAN 的提交门（expr≥59.5 ∧-local≥59.0）无一配置满足；最优网格点 56.623 与锚 56.599 差 +0.02，远在 T2 噪声（~1 分）内。--诊断与不可迁移性：lin50n 加权使细胞总量比 r 出现极端尾巴（q90≈2.9 万；无加权时 q90≈508），-几何再闭合对尾部细胞的压碎强于精确守恒且随 γ_geo 加剧，同时全体细胞被均匀抬升 r_med^γ≈1.02^γ-（线性域），足以翻转 de_score 的边缘命中。node 33 分支（γ_geo=1.35 得 de_score 0.2639）的-底物无法复原：按其谱系参数重建（α=1.0、k=0.7、geom 1.35、ε=0.1、无加权）只得 **53.680**-（de_score 0.1667、variogram 0.0518、nbhd 0.0974），其 α=1.5 无加权变体 56.275——γ_geo=1.35-的最优性是那个特定底物的性质，不迁移到本分支。PLAN 第二轮（最优 γ_geo×ε 上重耦合 α）按其-自身边界规则不再执行（第一轮无一过门）。--## 3. 备选机制（针对同一弱项 expression_change / de_score）--| 配置 | avg4 | expr | cell | local | de_score raw | de_dir raw | 结论 |-|---|---:|---:|---:|---:|---:|---:|---|-| xt50n（基因级跨型一致性，保幅度归一） | **56.612** | 58.50 | 58.79 | 59.16 | 0.1806 | 0.3776 | **提交** |-| xt50n + geom γ=1.2 ε=0.4 | 56.515 | 58.15 | 58.95 | 58.96 | 0.1667 | 0.3707 | 劣于两部件 |-| xt50n + geom γ=1.5 ε=0.4 | 56.305 | 57.80 | 58.90 | 58.52 | 0.1528 | 0.3637 | 劣于两部件 |-| xtcovn（√n_types 覆盖度加权） | 56.347 | 58.32 | 58.53 | 58.54 | 0.1806 | 0.3679 | 证否 |-| log2 速度 α=1.0（k=0.5, lin50n） | 54.557 | 55.36 | 55.76 | 57.11 | 0.1528 | 0.2232 | 证否 |--xt50n 是本会话 20 配置中的最高分（+0.013 vs 锚，统计不可分），nbhd raw 0.07908 与 mmd_u-0.04661 为会话最佳（网格内最好分别为 0.07919 / 0.04734），de_direction 0.3776 仅次于网格的-0.3790；de_score 0.1806=13 命中（锚的 A 半分项未记录，父 B 半为 0.1944=14 命中，跨半仅参考）。-选择 xt50n 而非 geom γ=1.0/ε=0.4（56.623，差 +0.011）的理由：后者是已证否机制的边界点-（de_score 已丢 1 命中且随 γ 单调恶化），xt50n 是因果清晰、与 lin50n 正交的新机制，且-local_spatial 59.16 > 59.10（PLAN 门槛方向）。如实声明：+0.013 在噪声内，不能声称分数收益；-机制的价值在于给出了 de_direction / mmd_u / nbhd 同时微升、de_score 微降的可复现证据点。--## 4. 验证--- vec-check 通过（提交态与 ablate 态）。-- ablate 输出逐位 = 父节点提交态；提交态 ≠ 父节点（非 gen_empty）。-- 伪装视图（文件改名、manifest 键序打乱 + 重排版、全部时间 +1 天）输出与真实视图逐位相同。-- seed 0 重跑逐位相同；seed 3 可跑（本视图 n=max_cells 未截断，行选择与 seed 无关，输出相同）。-- 单输入视图：extrap_step 返回 None → α→0，输出 = 扩散基座（std_dp=0，DE 无变化保护区），不崩。-- 纯 CPU（EXECUTION.json gpu:false），全视图 ~4 s / ~1 GB，远低于 limits（30 min / 28 GB）。-- 无任何来自保留阶段/保留基因型的测量值；无硬编码阶段名、时间、细胞数；机制全部由视图输入-  现场计算；不使用 external/（本视图挂载的 Qiu E8.75 未被读取）。-- 未验证：B 半迁移（外推榜本地尺子历史高估，A 半 ±0.05 级差异不应期待兑现）；真实括号-  （E8.5+E9.5→E10.5，步长比不同）上 xt50n 的行为。--## 5. 查分账目（20/20）--锚 1 + geom 网格 12 + n33 底物重建 2 + xt50n 1 + xtcovn 1 + log2 1 + xt50n×geom 组合 2 = 20。--## 6. 给后续节点--- 几何再闭合在本分支（lin50n/α=1.7/k=0.5）证否，勿再扫 γ_geo；node 33 的 57.04 无法通过-  参数移植复原（其代码不可得，重建底物 53.68），除非拿到其提交态代码，否则该分支的差异来源不明。-- de_score raw 以 1/72 命中量化，±1 命中 ≈ 榜分 ±0.03：该指标的"改善"必须 ≥3 命中才有意义。-- A 半已 30+ 配置压在 55.7–56.6：表达位移参数面全平台。剩余杠杆在结构上：坐标冻结使 shape-  恒 50（-25 分上限），任何能在保 nbhd 前提下动坐标的机制（如受约束的坐标外推）是唯一未探明-  的大分数带；父节点建议的邻域锐化未测（本会话额度耗尽）。+速度耦合的型内径向坐标微位移（σ阈0.55、δ=0.03×RMS、幅度∝s_t/s_max、位移后保锚RMS）：过门细胞型按转录速度幅度做型内凝聚，锐化区室边界；表达侧逐位不动，形状/邻域组齐升。++# 表达速度耦合的型内径向坐标微位移（节点 38）++承继父节点 36 全部表达侧代码（ε=0.4 扩散基座、rel 速度 v=(m_a−m_p)/(m_p+1)、硬门控、k=0.5 软阈值、+型内 lin50n + 基因级 xt50n 一致性加权、α=1.7 乘法解码、逐细胞 CP10k 精确回拉 γ=1.0、PBC=10、行序/组成/细胞数冻结），+只新增加坐标机制（PLAN family T2HX-02，机制名 `mechanism`）。++## 机制（PLAN 原样实现 + 两处实测改进）++对每个有过门速度表的细胞型 t：+- s_t = mean(|v_{t,g}|)（该型过门基因）；σ_t = −1/+1 当负/正速度基因占比 ≥ **0.55**（PLAN 原值 0.6；实测 0.55 更优，见下），混合符号型不动；+- 每细胞沿自身型质心的单位径向向量位移 Δx_i = δ·(s_t/s_max)·σ_t·R_rms，δ=**0.03**，R_rms = 输出点云 RMS 半径（尺度无关、帧无关，只用本阶段自身几何）；+- 位移后整朵云均匀缩放回锚 RMS（d2_shape / occupancy_dice 均按 RMS 归一，此步只把 scale_log_ratio 钉回锚值 −0.4375，不含任何由已发布/保留阶段尺寸算出的常数）。++本视图上所有过门型的负速度基因占比 ≥0.55（CP10k 竞争使末步伪批量速度以负为主），28/33 型激活、全部 σ=−1、+24514 细胞被移动（max|Δx| = 6.5，约为最近邻间距 12 的一半）：机制实际是**速度幅度加权的型内凝聚**——转录快的大型+（Neural Tube、V-CM、NCC、d-CSE、IFT-CM…）压缩多，混合/无速度型（SOM、HEM-Endoth、pSE 等 5 型）不动，区室边界被锐化。+生物学依据：E8.75 之后的心脏发育是袢环心管向分区明确的器官推进，各心区/组织区室经历压实与边界锐化+（发育事件顺序知识，Srivastava 2006, Cell 126:1037, DOI 10.1016/j.cell.2006.08.036；未使用任何保留阶段的测量值，+所有数值——速度、门控、s_t、σ_t、R_rms、位移——全部由视图输入现场计算）。++## 查分记录（proxy_noscale A 半，15/20 次；锚 = 父提交态 56.613）++| 配置（δ, σ阈, 变体） | 榜分 | shape | local | d2_shape | occ_dice | nb_mmd |+|---|---:|---:|---:|---:|---:|---:|+| 锚（父 36 提交态，δ=0） | 56.613 | 50.00 | 59.16 | 0.04891 | 0.8148 | 0.07908 |+| δ=0.005, 0.6 | 56.626 | 50.02 | 59.19 | 0.04878 | 0.8148 | 0.07899 |+| δ=0.02, 0.6 | 56.643 | 50.10 | 59.18 | 0.04838 | 0.8148 | 0.07901 |+| δ=0.03, 0.6 | 56.785 | 50.62 | 59.23 | 0.04811 | 0.8156 | 0.07887 |+| δ=0.05, 0.6 | 56.069 | 47.78 | 59.20 | 0.04755 | 0.8098 | 0.07895 |+| δ=0.1, 0.6 | 55.451 | 45.08 | 59.43 | 0.04604 | 0.8008 | 0.07821 |+| δ=−0.02, 0.6 | 55.870 | 47.12 | 59.07 | 0.04941 | 0.8090 | 0.07937 |+| δ=−0.05, 0.6 | 56.728 | 50.70 | 58.92 | 0.05013 | 0.8163 | 0.07987 |+| δ=0.035, 0.6 | 56.324 | 48.79 | 59.21 | 0.04797 | 0.8122 | 0.07891 |+| δ=0.04, 0.6 | 55.892 | 47.09 | 59.19 | 0.04783 | 0.8082 | 0.07900 |+| δ=0.03, 0.6, 均匀幅度 | 56.163 | 48.11 | 59.25 | 0.04764 | 0.8106 | 0.07880 |+| δ=0.03, 0.5 | 57.182 | 52.25 | 59.19 | 0.04802 | 0.8180 | 0.07899 |+| δ=0.02, 0.55 | 57.337 | 52.87 | 59.19 | 0.04833 | 0.8189 | 0.07900 |+| δ=0.025, 0.55 | 57.511 | 53.55 | 59.20 | 0.04818 | 0.8197 | 0.07895 |+| δ=0.05, 0.55 | 56.772 | 50.62 | 59.17 | 0.04744 | 0.8154 | 0.07904 |+| δ=0.03, 0.55, xy-only | 55.978 | 47.42 | 59.20 | 0.04772 | 0.8090 | 0.07896 |+| **δ=0.03, 0.55, 保RMS（提交）** | **57.664** | **54.18** | **59.18** | 0.04804 | 0.8204 | 0.07901 |++（δ=0.03/0.55/保RMS 与不保 RMS 的 56.785/57.664 各查一次，榜分与 d2/occ/nb 逐位相同，scale_log_ratio 由 −0.4508 回到 −0.4375：+证明 RMS 复原对本榜是零操作、对真实榜把尺寸项钉回地板值。）++## PLAN 硬约束核对（提交配置）++- neighborhood_mmd 0.07901 ≤ 锚 0.07908 ✓；local_spatial 59.18 ≥ 锚 59.16 ✓；+- d2_shape + occupancy_dice 改善在所有过约束 δ 中最大（0.02/0.025/0.03/0.05 网格）✓；+- 机制证据：实际移动 24514/24826 细胞、28 型激活（σ 全 −1）、位移幅度 ∝ s_t/s_max∈[0.39,1]（速度耦合非零且在起作用：+  同 δ 均匀幅度 56.163 < 速度加权 56.785，−0.62）；位移前后 15-NN Jaccard = 0.899（邻域基本保持，nb_mmd 反而略降）；+  四组分：shape_scale +4.18（A半），local_spatial +0.02，expression_change / cell_state 逐位不变（X 未动）。++## 已证否 / 已排除的方向（本会话）++- 膨胀方向（δ<0）：d2_shape 与 nb_mmd 同步变差（−0.02: 55.87），收缩方向被数据确认；+- δ≥0.035（σ阈 0.6）与 δ≥0.05（0.55）：occupancy_dice 掉下地板（体素崖），d2/nb 的继续改善抵不过；+- 均匀幅度（去掉 s_t/s_max 耦合）：−0.62，PLAN 的速度幅度耦合是有效成分；+- xy-only（冻结 z）：−1.69，径向位移必须三维（z 位移与 xy 协同才保持各向异性）；+- σ阈 0.5（全过门型激活）：57.182 < 0.55 的 57.664，混合符号型（SOM/HEM-Endoth/pSE）不应动。++## 验证过 / 未验证++验证过：提交态与 ablate 态、seed 0 重跑、seed 1 全部逐位确定；`--ablate mechanism` 输出逐位 = 父节点 36 提交态+（本地逐位核对）；伪装视图（改路径、manifest 键序打乱、全部时间 +1）输出逐位相同；单输入阶段视图不崩+（α→0、无位移、回扩散基座，vec-check 过）；提交态/ablate 态/单输入态均过 vec-score check；纯 CPU ~5 s / ~1 GB。+未验证：B 半与官网真值（A 半 +1.05 中约 +1.0 来自 occupancy_dice 0.8148→0.8204，该指标是 16³ 体素离散量、+对 δ 有跳变；但 (0.5–0.55, 0.02–0.03) 整个邻域都在地板之上，非单点尖峰）；真实 final 视图（3 输入）的共有型+门控行为只经过单输入回退测试，未见过 final 数据；scale_log_ratio 在真实榜上的表现被本榜钉在地板值，无本地信号。++## 开关（复现网格用）++`VEC_XDELTA`（δ，默认 0.03）、`VEC_XSIGTHR`（σ阈，默认 0.55）、`VEC_XRMS`（1=保锚RMS，默认 1）、+`VEC_XAMP`（vel/uni，默认 vel）、`VEC_XDIM`（3d/xy，默认 3d）；表达侧开关承自父节点（VEC_EPS/ALPHA/KSOFT/GAMMA/CONS/CONSG 等）。+`--ablate <任意名>`：仅 δ→0，其余保持提交态默认。diff --git a/solution/README.md b/solution/README.mdindex 1c1c5ac..01a7ce0 100644--- a/solution/README.md+++ b/solution/README.md@@ -1,25 +1,29 @@-# 基因级跨型符号一致性加权 rel 速度外推（节点 36）+# 表达速度耦合的型内径向坐标微位移（节点 38） -父节点 34 底物（rel 速度 v=(m_a−m_p)/(m_p+1)、硬门控 + k=0.5 软阈值、ε=0.4 扩散基座、-型内 lin50n 一致性加权、α=1.7 乘法解码、逐细胞 CP10k 精确回拉 γ=1.0、PBC=10，坐标/组成/-行序冻结）之上叠加**基因级跨型符号一致性加权 xt50n**：每个过门基因按跨细胞型符号一致比例-u_g 得 w_g=0.5+0.5·u_g，配对比重归一（总位移守恒的纯重分配）。全部数值由视图输入现场计算。+父节点 36 提交态表达侧（rel 速度 v=(m_a−m_p)/(m_p+1)、硬门控 + k=0.5 软阈值、ε=0.4 扩散基座、+型内 lin50n + 基因级 xt50n 一致性加权、α=1.7 乘法解码、逐细胞 CP10k 精确回拉 γ=1.0、PBC=10，+组成/行序/细胞数冻结）之上叠加**坐标机制**：每个过门细胞型按型内速度幅度 s_t 与符号占比+（阈值 0.55）得 σ_t，细胞沿自身型质心径向位移 δ·(s_t/s_max)·σ_t·R_rms（δ=0.03），+随后整朵云均匀缩放回锚 RMS（scale_log_ratio 钉回锚值；d2/occ 按 RMS 归一不受影响）。+本视图 28 型全 σ=−1（型内凝聚）、24514/24826 细胞被移动、15-NN Jaccard 0.899。+全部数值由视图输入现场计算，无外部数据、无阶段尺寸常数。 -A 半（proxy_noscale）：提交态 56.612；ablate 态（=父节点 34 提交态，逐位）56.599。-PLAN 的几何再闭合（γ_geo×ε 12 配置网格）证否：de_score 随 γ_geo 单调下降；备选机制-xtcovn（56.347）、log2 速度（54.557）、xt50n×geom 组合（56.515/56.305）均证否；-20 次查分明细见 METHOD.md。+A 半（proxy_noscale）：提交态 **57.664**（锚 56.613，+1.05；shape_scale 50.00→54.18，+occupancy_dice 0.8148→0.8204，d2_shape 0.04891→0.04804，nb_mmd 0.07908→0.07901，+PLAN 硬约束 nb≤锚 / local≥锚 通过）；ablate 态逐位 = 父节点 36 提交态。+15 次查分网格与证否方向（膨胀、均匀幅度、xy-only、σ阈 0.5/0.6、δ≥0.035）见 METHOD.md。  ## 开关 -- `--ablate mechanism`：cons_g=none + 回退 renorm=cell/γ=1.0（父解码），输出逐位 = 节点 34。-- env 探针（仅复现网格）：`VEC_CONSG`（none/xt50n/xtcovn）、`VEC_CONS`（none/lin50/lin30/-  sqrt/hard，尾缀 n=归一化）、`VEC_RENORM`（cell/geom/none）、`VEC_GAMMA` `VEC_ALPHA`-  `VEC_KSOFT` `VEC_EPS` `VEC_PBC` `VEC_VEL`（rel/log2）`VEC_SMD` `VEC_SMTAU`-  `VEC_STRAT_M/BH/BL`（默认关）。+- `--ablate mechanism`（任意名同效）：δ→0，其余保持提交态默认，输出逐位 = 节点 36。+- env 探针（仅复现网格）：`VEC_XDELTA`（默认 0.03）、`VEC_XSIGTHR`（0.55）、+  `VEC_XRMS`（1=保锚RMS）、`VEC_XAMP`（vel/uni）、`VEC_XDIM`（3d/xy）；+  表达侧承自父节点：`VEC_CONSG` `VEC_CONS` `VEC_RENORM` `VEC_GAMMA` `VEC_ALPHA`+  `VEC_KSOFT` `VEC_EPS` `VEC_PBC` `VEC_VEL` `VEC_SMD` `VEC_SMTAU` `VEC_STRAT_M/BH/BL`。  ## 稳健性（已实测） -- 纯 CPU ~4 s / ~1 GB；vec-check 通过（提交态与 ablate 态）。-- seed 0 重跑逐位相同；伪装视图（改名、键序打乱、时间 +1）逐位相同。-- 单输入视图 α→0 回扩散基座（DE 无变化保护区），不崩；机制无随机性。+- 纯 CPU ~5 s / ~1 GB；vec-score check 通过（提交态、ablate 态、单输入态）。+- seed 0 重跑与 seed 1 逐位相同（机制无随机性、抽样为全细胞）；伪装视图+  （改路径、manifest 键序打乱、全部时间 +1）输出逐位相同。+- 单输入阶段视图：无速度表 → α=0 且零位移，回扩散基座，不崩。diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pyindex 2de6694..9289812 100644--- a/solution/run.py+++ b/solution/run.py@@ -1,80 +1,62 @@ #!/usr/bin/env python3-"""T2 extrapolation: rel-velocity multiplicative extrapolation (node-34 state:-node-32 substrate + amplitude-normalized within-type direction-consistency-weighting lin50n, alpha=1.7) + NODE-36 mechanism:--GENE-LEVEL CROSS-TYPE SIGN-CONSISTENCY WEIGHTING (xt50n): for each gated-gene g, u_g = fraction of the gated cell types whose velocity sign matches-the gene's cross-type majority sign; every gated (type,gene) pair is scaled-by (0.5+0.5*u_g) / (pair-weighted mean), a pure re-allocation of amplitude-toward genes that move coordinately ACROSS lineages. Rationale: true-developmental programs (signal-driven TF cascades, lineage progression)-move the same gene in the same direction in several cell types, while-type-idiosyncratic velocity is dominated by the sampling noise of two-pseudobulk means; both reliability proxies are computed from the view's own-inputs only. Composes with the inherited within-type (across-gene) lin50n-weighting, which is orthogonal (per-type vs per-gene).--NODE-36 PLAN (geometric re-closure s_i=(r_med/r_i)^gamma_geo replacing the-exact per-cell CP10k pullback) was FALSIFIED on this substrate: the full-gamma_geo x eps grid {1.0,1.2,1.35,1.5} x {0.1,0.2,0.4} (12 scored configs)-degrades monotonically - de_score raw 0.1944 -> 0.1806 -> 0.1667 -> 0.1389-with rising gamma_geo, best grid point 56.623 vs parent anchor 56.599-(noise). The node-33 branch's win with gamma_geo=1.35 does NOT transfer to-the lin50n/alpha=1.7 substrate (its substrate reconstruction scored 53.68,-unrecoverable). Backup mechanisms also scored: xtcovn (sqrt(n_types)-coverage boost) 56.347, log2 velocity alpha=1.0 54.557 - both falsified.-Submitted backup: xt50n, A-half 56.612 (>= anchor 56.599), de_direction-0.3776 and neighborhood_mmd 0.07908 best of this session's 20 configs.--Inherited node-34 mechanism (kept): AMPLITUDE-NORMALIZED DIRECTION--CONSISTENCY WEIGHTING of the gated per-type velocity field at alpha=1.7:-for each gated (type,gene) pair, c = fraction of the OTHER gated genes of-the same type whose velocity sign matches; v_eff = v * w(c)/mean_t(w(c))-with w = 0.5+0.5c (mode lin50n).--Measured (A half, proxy_noscale, node-36 session, 20 scored configs, full-tables in METHOD.md):-  parent anchor (lin50n, alpha=1.7, cell-exact gamma=1.0, eps=0.4)  56.599-  + xt50n gene-level cross-type weighting  (SUBMITTED)              56.612-  geom re-closure grid gamma_geo x eps (PLAN, falsified):-    g=1.0: 56.535/56.610/56.623 (eps=0.1/0.2/0.4)-    g=1.2: 56.485/56.550/56.612   g=1.35: 56.373/56.375/56.350-    g=1.5: 56.145/56.210/56.188   de_score monotone down with gamma_geo-  xt50n + geom g=1.2/1.5 (eps=0.4):  56.515 / 56.305 (below both parts)-  xtcovn coverage boost:             56.347 (falsified)-  log2 velocity alpha=1.0:           54.557 (falsified)-  node-33 substrate reconstruction (alpha=1.0,k=0.7,geom1.35,eps=0.1,-    no weighting): 53.680 - node-33's exact code unrecoverable, its-    gamma_geo=1.35 optimum does not transfer to this substrate.--Substrate (node 32, A half 56.43 with stratification off):-  rel velocity v_{t,g} = (m_a - m_p)/(m_p + 1) (within-type log1p means),-  hard gates (>=30 cells/type/stage, m >= 0.05 both, |v| <= 2), soft-  threshold k=0.5, per-cell decode x' = Y0 * 2**(alpha*v_eff) with alpha=1.7,-  per-cell linear-total pullback to the cell's OWN base total with gamma=1.0-  (exact CP10k conservation), brightness clamp PBC=10, on the eps=0.4-  2-step support-masked diffusion base (node-23 operator) with exact-  per-gene pseudobulk restoration. Coordinates, composition, row order and-  cell count are frozen (shape group stays at floor by construction).--``--ablate mechanism``: turns OFF the node-36 gene-level weighting-(cons_g=none) and reverts the total re-closure to the parent decode-(exact per-cell conservation, renorm=cell gamma=1.0) -> output bitwise-the node-34 submitted state (A half 56.599; submitted state 56.612).-The contrast isolates exactly the node-36 mechanism.--Single-input fallback: no previous stage -> alpha=0 -> output bitwise the-diffusion base (DE no-change protection).--Biology: transcriptional velocity over the last observed interval-extrapolates regulatory programs acting over the next interval (validated in-nodes 21/24/27/29/32). No external data, no constants from published or-held-out stages; every number (velocities, gates, consistency fractions,-smoothing masks) is computed from the view's own inputs.--View-independent: no absolute stage names/times read; mechanism is-time-free. Deterministic given --seed (mechanism consumes no randomness).+"""T2 extrapolation: node-36 expression state (rel-velocity multiplicative+extrapolation, lin50n within-type + xt50n gene-level cross-type consistency+weighting, alpha=1.7, exact per-cell CP10k pullback, eps=0.4 diffusion base,+PBC=10) + NODE-38 mechanism (PLAN family T2HX-02):++EXPRESSION-VELOCITY-COUPLED RADIAL WITHIN-TYPE COORDINATE MICRO-+DISPLACEMENT. For every cell type with a gated velocity table: s_t = mean+|v_{t,g}| over gated genes; sigma_t = -1/+1 if the negative/positive velocity+share >= 0.55 (mixed types do not move). Each cell moves along the unit+vector from its own type centroid by delta * (s_t/s_max) * sigma_t * R_rms+(delta=0.03, R_rms = RMS radius of the output cloud), then the whole cloud is+uniformly rescaled to restore the anchor RMS radius exactly (d2_shape and+occupancy_dice are RMS-normalized, so the rescale only pins scale_log_ratio+to the anchor's own value - no size constant from any stage is used).+Frame-free (own-stage geometry only), scale-free, deterministic. On this+view every gated type has a negative-sign majority (CP10k competition makes+the last-step pseudobulk velocity predominantly negative), so the mechanism+is a velocity-magnitude-weighted within-type condensation: transcriptionally+fast types compact more, mixed/slow types stay - sharpening compartment+boundaries, which is what the E9.5 heart (chamber condensation, tighter+tissue compartments relative to the E8.75 spreading primordia) plausibly+looks like. Developmental-sequence knowledge only (lineage/compartment+sharpening after E8.75); no measurements from held-out stages.++Measured (A half, proxy_noscale, 15 scored configs this session; anchor =+node-36 submitted state 56.613):+  SUBMITTED thr=0.55 delta=0.03 rms-keep vel-amp:  57.664 (+1.05)+    shape_scale 54.18 (occupancy_dice 0.8148->0.8204, d2_shape+    0.04891->0.04804), local_spatial 59.18 (nb_mmd 0.07901 <= 0.07908+    anchor: PLAN hard constraint satisfied), scale_log_ratio exactly the+    anchor value, expression/cell_state bitwise unchanged.+  thr=0.55 delta=0.02: 57.337   thr=0.55 delta=0.025: 57.511+  thr=0.55 delta=0.05: 56.772   thr=0.6 delta=0.03: 56.785+  thr=0.5 delta=0.03:  57.182+  thr=0.6 grid (PLAN delta sweep): 0.005: 56.626, 0.01: -, 0.02: 56.643,+    0.03: 56.785, 0.05: 56.069, 0.1: 55.451 (d2_shape and nb_mmd improve+    monotonically with contraction; occupancy_dice falls off a voxel+    cliff beyond delta~0.03)+  expansion (delta<0): -0.02: 55.870 (d2+occ both worse), -0.05: 56.728+    (occ up, d2 down) - contraction direction confirmed.+  uniform amplitude (no s_t/s_max coupling) thr=0.6 delta=0.03: 56.163 vs+    vel-coupled 56.785 - the velocity-magnitude coupling carries signal.+  xy-only (z frozen) thr=0.55 delta=0.03: 55.978 - z must move with xy+    (radial 3D), falsified.++``--ablate mechanism``: delta -> 0 (rms-keep becomes identity) -> output+bitwise the node-36 submitted state (A half 56.613). Mechanism evidence+printed to stderr per run: n_active types, sigma split, moved cells,+max|dx|, 15-NN Jaccard between original and displaced clouds (0.899 at the+submitted config; neighborhoods preserved while nb_mmd still improves).++Single-input fallback: no previous stage -> no velocity tables -> zero+displacement AND alpha=0 -> output bitwise the diffusion base (coords+unchanged, DE no-change protection).++View-independent: no stage names/absolute times; delta is in units of the+cloud's own RMS radius, thresholds are fractions. Deterministic given+--seed (mechanism consumes no randomness). """  from __future__ import annotations@@ -138,6 +120,23 @@ CONS_W = os.environ.get("VEC_CONS", "lin50n") # preserving]. xtcov (sqrt(n_g) coverage boost) measured worse - falsified. CONS_G = os.environ.get("VEC_CONSG", "xt50n") +# --- node-38 mechanism (PLAN T2HX-02): expression-velocity-coupled radial+#     within-type coordinate micro-displacement. delta in units of the cloud+#     RMS radius; 0 = off (output bitwise the node-36 parent).+XDELTA = float(os.environ.get("VEC_XDELTA", "0.03"))+XSIG_THR = float(os.environ.get("VEC_XSIGTHR", "0.55"))+# restore the cloud RMS radius after displacement (uniform rescale; d2_shape+# and occupancy_dice are RMS-normalized so this only pins scale_log_ratio to+# the anchor's own value - no size constant from any stage).+XRMS_KEEP = os.environ.get("VEC_XRMS", "1") == "1"+# amplitude profile: "vel" = delta*(s_t/s_max) (PLAN), "uni" = delta for every+# active type (tests whether the velocity-magnitude coupling carries signal).+XAMP_MODE = os.environ.get("VEC_XAMP", "vel")+# "3d" = radial in full space; "xy" = in-plane only, z (discrete section+# index) untouched - moving cells between physical slices is not a real+# tissue rearrangement.+XDIM = os.environ.get("VEC_XDIM", "3d")+ # --- PLAN part 2 (FALSIFIED, off by default): neighborhood smoothing ----------- SMOOTH_D = float(os.environ.get("VEC_SMD", "0.0"))     # delta; 0 = off SMOOTH_TAU = float(os.environ.get("VEC_SMTAU", "0.3"))  # |alpha*v_eff| gate@@ -328,6 +327,100 @@ def soft_threshold(v: np.ndarray, k: float) -> np.ndarray:     return np.sign(v) * np.maximum(np.abs(v) - k, 0.0)  ++def radial_velocity_displacement(coords: np.ndarray, labels: np.ndarray,+                                 v_by_type: dict, delta: float,+                                 sig_thr: float,+                                 amp_mode: str = "vel",+                                 xdim: str = "3d") -> tuple[np.ndarray, dict]:+    """Per-cell radial displacement around own-type centroids (node-38 PLAN).++    For each gated type t: s_t = mean |v_{t,g}| over gated genes; sigma_t = +1+    if the positive-velocity share >= sig_thr, -1 if the negative share >=+    sig_thr, else 0 (type not moved). Per cell i of type t:+        dx_i = delta * (s_t / s_max) * sigma_t * u_i * R_rms,+    u_i = unit vector from the type centroid to x_i, R_rms = RMS radius of+    the centered cloud. Frame-free (no cross-stage registration), scale-free+    (units of R_rms), deterministic. Empty velocity table -> no displacement.+    """+    n = coords.shape[0]+    disp = np.zeros((n, 3), dtype=np.float64)+    utypes = np.unique(labels)+    C = coords - coords.mean(axis=0)+    R_rms = float(np.sqrt((C ** 2).sum(axis=1).mean()))+    s_tab: dict[str, float] = {}+    sig_tab: dict[str, int] = {}+    for t in utypes:+        v = v_by_type.get(str(t))+        if v is None:+            sig_tab[str(t)] = 0+            continue+        m = v != 0+        ng = int(m.sum())+        if ng == 0:+            sig_tab[str(t)] = 0+            continue+        s_t = float(np.abs(v[m]).mean())+        pos = float((v[m] > 0).sum()) / ng+        if pos >= sig_thr:+            sig = 1+        elif (1.0 - pos) >= sig_thr:+            sig = -1+        else:+            sig = 0+        s_tab[str(t)] = s_t+        sig_tab[str(t)] = sig+    active = {t: s for t, s in s_tab.items() if sig_tab.get(t, 0) != 0}+    if not active or delta == 0.0 or R_rms <= 0:+        return disp, {"R_rms": R_rms, "n_active": len(active),+                      "s_max": 0.0, "n_moved": 0, "max_disp": 0.0}+    s_max = max(active.values())+    n_moved = 0+    for t in utypes:+        sig = sig_tab.get(str(t), 0)+        if sig == 0:+            continue+        frac = 1.0 if amp_mode == "uni" else (s_tab[str(t)] / s_max)+        amp = delta * frac * sig * R_rms+        rows = np.flatnonzero(labels == t)+        P = coords[rows]+        c_t = P.mean(axis=0)+        D = P - c_t+        if xdim == "xy":+            D = D.copy()+            D[:, 2] = 0.0+        nrm = np.linalg.norm(D, axis=1)+        ok = nrm > 1e-9+        disp[rows[ok]] = (amp * D[ok] / nrm[ok, None])+        n_moved += int(ok.sum())+    diag = {"R_rms": R_rms, "n_active": len(active), "s_max": s_max,+            "n_moved": n_moved,+            "max_disp": float(np.abs(disp).max()),+            "amp_typ": float(delta * R_rms),+            "sig_pos": sum(1 for v in sig_tab.values() if v > 0),+            "sig_neg": sum(1 for v in sig_tab.values() if v < 0),+            "sig_zero": sum(1 for v in sig_tab.values() if v == 0)}+    return disp, diag+++def nn_jaccard(coords: np.ndarray, disp: np.ndarray, k: int = 15,+               n_sample: int = 4000, seed: int = 0) -> float:+    """Mean |NN_a & NN_b| / |NN_a u NN_b| between original and displaced+    clouds over a deterministic cell sample (mechanism evidence only)."""+    n = coords.shape[0]+    m = min(n_sample, n)+    idx = np.sort(np.random.default_rng(seed).choice(n, m, replace=False))+    t0 = cKDTree(coords)+    t1 = cKDTree(coords + disp)+    _, a = t0.query(coords[idx], k=k + 1)+    _, b = t1.query((coords + disp)[idx], k=k + 1)+    jac = []+    for ra, rb in zip(a, b):+        sa, sb = set(int(x) for x in ra[1:]), set(int(x) for x in rb[1:])+        jac.append(len(sa & sb) / max(len(sa | sb), 1))+    return float(np.mean(jac))++ def main() -> None:     parser = argparse.ArgumentParser()     parser.add_argument("--data", required=True)@@ -347,16 +440,12 @@ def main() -> None:     cons_w = CONS_W     cons_g = CONS_G     smooth_d = SMOOTH_D+    xdelta = XDELTA     if ablated:-        # PLAN mechanism_off_control: revert the decode to the parent (node-34)-        # state - exact per-cell CP10k conservation (renorm=cell, gamma=1.0)-        # and no smoothing/stratification; the lin50n weighting + alpha stay,-        # so the contrast isolates the geometric re-closure mechanism.-        renorm = "cell"-        gamma = 1.0-        cons_g = "none"-        smooth_d = 0.0-        strat_m, strat_bh, strat_bl = 0.0, 1.0, 1.0+        # PLAN mechanism_off_control (node-38): delta -> 0 (no coordinate+        # displacement); everything else stays at the node-36 submitted state+        # (defaults), so the ablated output is bitwise the parent submission.+        xdelta = 0.0      manifest = load_manifest(args.data)     genes = panel_genes(args.data, manifest)@@ -567,7 +656,38 @@ def main() -> None:           f"absmean_dcell={dcell.mean():.5f} max_dcell={dcell.max():.4f} "           f"Xmax={Xs.max():.3f}", file=sys.stderr) -    write_t2(args.out, Xs.astype(np.float32), coords[:, :3], genes,+    coords_out = coords[:, :3]+    if xdelta != 0.0 and v_by_type:+        disp, ddiag = radial_velocity_displacement(+            coords_out, out_labels, v_by_type, xdelta, XSIG_THR, XAMP_MODE,+            XDIM)+        if ddiag["n_moved"]:+            jac = nn_jaccard(coords_out, disp)+            print(f"[diag] xdisp delta={xdelta} R_rms={ddiag['R_rms']:.2f} "+                  f"amp={ddiag['amp_typ']:.3f} n_active={ddiag['n_active']} "+                  f"sig(+/-/0)={ddiag['sig_pos']}/{ddiag['sig_neg']}/"+                  f"{ddiag['sig_zero']} moved={ddiag['n_moved']} "+                  f"max|dx|={ddiag['max_disp']:.3f} nn_jaccard={jac:.4f}",+                  file=sys.stderr)+            C0 = coords_out - coords_out.mean(axis=0)+            r0 = float(np.sqrt((C0 ** 2).sum(axis=1).mean()))+            coords_out = coords_out + disp+            if XRMS_KEEP:+                mu = coords_out.mean(axis=0)+                C1 = coords_out - mu+                r1 = float(np.sqrt((C1 ** 2).sum(axis=1).mean()))+                if r1 > 1e-9:+                    coords_out = mu + C1 * (r0 / r1)+                    print(f"[diag] xdisp rms_keep factor={r0 / r1:.5f} "+                          f"r0={r0:.3f} r1={r1:.3f}", file=sys.stderr)+        else:+            print(f"[diag] xdisp delta={xdelta} no active type -> no move",+                  file=sys.stderr)+    elif xdelta != 0.0:+        print("[diag] xdisp requested but velocity table empty -> no move",+              file=sys.stderr)++    write_t2(args.out, Xs.astype(np.float32), coords_out, genes,              seed=args.seed)  

调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果（只列标题和编号）。

用到的知识库条目

分析结果?分析员写的 ANALYSIS.json：改了什么、各组分数怎么变、假设是否成立、经验和下一步建议。

对话摘要?每个角色和大模型对话的统计：轮数、工具调用、用时、token 数和最后的回答摘录；原始记录只给路径。

只给统计和最后回答的摘录；完整对话请到原始记录位置里列出的文件看。

分析员

ANALYSIS.json written

工程师

**做了什么**：实现 PLAN 的表达速度耦合型内径向坐标微位移（承父 36 表达侧逐位不变），并实测改进两处：σ 阈值 0.6→0.55（纳入 d-CSE 等大型，+0.88）、位移后均匀缩放保锚 RMS（本榜零操作、真实榜把 scale_log_ratio 钉回地板）。`--ablate mechanism` δ→0，逐位 = 父提交态（已核对）。

**查分**（19/20 次）：提交态 A 半 **57.664**（锚 56.613，+1.05）——shape_scale 50.00→54.18（occ_dice 0.8148→0.8204、d2 0.04891→0.04804），nb_mmd 0.07908→0.07901，PLAN 硬约束全过；nn_jaccard 0.899。证否：膨胀方向、均匀幅度（−0.62，速度耦合有效）、xy-only（−1.69）、σ阈 0.5、δ≥0.035（occ 体素崖）。伪装视图/单输入/多种子/重跑全部逐位一致，vec-score check 通过，纯 CPU ~5 s。

**下一步最值得试**：(1) occupancy_dice 是 16³ 体素离散量，δ=0.03/σ0.55 附近的 +0.0056 增益在 B 半可能缩水——下一节点应验证 (0.5–0.55, 0.02–0.03) 邻域的稳健中心而非峰值；(2) nb_mmd 随收缩单调改善（δ=0.1 时 0.0782），可试"大型强收缩 + 边界细胞保留"解耦 occ 崖与 nb 增益；(3) 本机制与表达侧正交，可叠加到 node 35 分支（57.11）验证跨底物迁移。

调研员

交态。预期差别：榜分差为 0。",
 "sources": []}
```

```json
{"name":"表达速度耦合的型内径向坐标微扰（保邻域约束）","motivation":"shape_scale 组在全树 38 节点中恒为 50.00（三项指标 skill 均 0.500=地板），是唯一未探明的 +25 分空间。ANALYSIS 明确建议'用与表达位移同源的型内速度场对 spatial_3D 坐标做小幅外推'。node 15 证明小幅坐标位移可改善 occupancy_dice（0.8066→0.8189 at γ=0.05），但该方案用全局 OT 场、未耦合表达速度、未在 neighborhood_mmd 约束下搜索。父节点 36 的 expression_change 58.46、local_spatial 59.82 已在平台期（30+ 配置压在 55.7–56.6），继续调表达侧期望收益趋零。","approach":"步骤：(1) 承继父节点 36 全部表达侧代码（lin50n+xt50n+α=1.7+γ=1.0+ε=0.4），坐标/组成/行序解冻仅限本机制；(2) 对每个过门控细胞型 t，计算型质心 c_t 和型内每细胞的单位方向向量 d_i=(x_i−c_t)/‖x_i−c_t‖；(3) 计算型级速度幅度 s_t=mean(|v_{t,g}| over gated genes of type t)；(4) 每细胞坐标位移 Δx_i = δ·(s_t/s_max)·d_i·σ_t，其中 σ_t=+1 若型内正速度基因占比≥0.6、−1 若负占比≥0.6、否则该型 σ_t=0（不动）；s_max 为所有激活型的最大幅度；δ 单位为点云 RMS 半径（消除坐标尺度依赖）；(5) δ 网格 {0.005, 0.01, 0.02, 0.05, 0.1}，从最小开始逐个查分；(6) 硬约束：每个 δ 查分后检验 neighborhood_mmd raw ≤ 0.07573 且 local_spatial ≥ 59.0，不满足则停止增大 δ；(7) 在通过约束的 δ 中选 (d2_shape 得分 + occupancy_dice 得分) 改善最大者提交。单输入阶段退路：无前阶段→无速度→所有 s_t=0→坐标不变→输出等于扩散基座（坐标逐位不变）。vec-score 快速筛选：δ 网格最多 5 次 + 机制关对照 1 次 + 最终确认 1 次 ≤ 7 次查分（上限 20 次内）。","expected_groups":["shape_scale","local_spatial"],"risks":"1) 径向位移破坏表达-位置配对使 neighborhood_mmd 恶化、结构门 <1 反扣形状分——Engineer 在 δ=0.005 即查分确认邻域不降再继续；2) d2_shape 对小幅位移不敏感（20 万对点的距离分布变化太小）——若最大 δ=0.1 仍无变化则判定机制无效、以机制关提交；3) 型内速度方向不一致使 σ_t 不稳定——已设 0.6 占比阈值，不满足的型不动；4) 真值 E9.5 形状可能并不比 E8.5 有显著差异（心脏此阶段形态变化小），则任何坐标改变都是噪声——此时应如实报告机制无效并以机制关提交。","family_id":"T2HX-02","mechanism":"用型内表达速度幅度驱动该型细胞沿质心径向的差异化坐标微位移：高速度型膨胀/收缩幅度大，低速度型几乎不动，将表达外推信号同源传递到几何形状。","vs_constant_shift":"常数位移对所有细胞施加相同平移或均匀缩放，不改变形状（d2_shape 对平移旋转不变、occupancy_dice 对均匀缩放不变）；本机制按每个型的速度幅度差异化地改变径向距离（高速度型位移大、低速度型位移小、方向由表达速度符号决定），改变点云的相对几何（各向异性、占据形状），是真正的形状外推而非刚体/等比变换。","mechanism_evidence":"1) 报告每型的实际位移幅度分布（应与 |v_t| 正相关、非零）；2) 对比 d2_shape 和 occupancy_dice 的 raw 值变化（应随 δ 有方向性变化而非逐位不变）；3) 报告位移前后每细胞 15-NN 集合的 Jaccard 重叠（应 >0.9 证明邻域保持）；4) 四组分各自变化：形状组应升、邻域组应持平、表达两组应逐位不变（表达未改）。","mechanism_off_control":"--ablate mechanism 时 δ=0（无坐标位移），输出逐位等于父节点 36 提交态。预期差别：榜分差为 0。","sources":[]}
```