运行链

审查意见?审查员（Reviewer）检查程序是否越界读取、写死目标或钻评分器漏洞后的意见。 通过 seed (human-written, locked)

分析员结论?分析员（Analyst）看完分数后写下的第一条经验。：对锚阶段表达沿顶部 PC 做对称放大时，伪批量位移≈0，唯一 dp 来自 clip(0) 对零膨胀基因的非对称抬升；该 dp 排序反预测真实上调集（de_score −0.58~−0.60），且秩对 alpha 大小不变，缩小 alpha 无法救回符号。

审查意见 通过 检查1（越界读取）：未发现问题——run.py 仅通过 src.task2_spatial.view_io 的 load_manifest/anchor_entry/read_stage/panel_genes 读取 --data 视图内的锚阶段（E8.75 输入），无绝对路径、'..'、/mnt、/home、data/raw、打分器路径，无联网；未读取目标阶段文件。; 检查2（硬编码目标统计量）：未发现问题——run.py 无任何写死

分析员结论：在 T2 heart 外推榜上，E8.25→E8.75 全局速度经 PC5/PC8（|投影| 3.4）去噪后做定向位移，de_score 原始值仅 +0.042（低于 PLAN 阈值 0.05）、de_direction −0.015：前一区间的速度方向对下一区间真值变化的秩预测力≈0，线性外推方向在该榜不成立。

审查意见 通过 1 越界读取：未发现问题——run.py 仅通过 view_io（load_manifest/read_stage/panel_genes/anchor_entry）读取 --data 视图内输入阶段（run.py:81-97），无绝对路径、..、external/、prior/ 或评分器路径访问，无联网；METHOD.md:31 声明 external Qiu E8.75 未读，与代码一致。; 2 硬编码目标统计量：未发现问题——程序

分析员结论：在 T2:heart:val_extrap 的 copy_last 基座上，只重排“细胞↔坐标”配对（表达矩阵与坐标点集逐位不变）的有界2-opt，smooth B∈{2%,5%,10%} 与 sharpen B=5% 都无法把 neighborhood_mmd 推离地板：Engineer 报告 local_spatial 仅在 50.00–50.03 波动（远小于 T2 约 1 分噪声），机制运行（499/620/1241 次交换）但无有效信号。

审查意见 通过 1 越界读取：未发现问题——run.py 只经 load_manifest/read_stage/panel_genes 读 args.data 视图内数据（run.py:121-123），无绝对路径、'..'、/mnt、external 或评分器路径，无联网。; 2 硬编码目标统计量：未发现问题——细胞数取自 manifest 的 min_cells/max_cells（run.py:124），基因取自 panel_genes，代码中

分析员结论：在 T2:heart:val_extrap 的 copy_last 基座上，沿锚阶段 PCA 轴做乘性方差缩放（α∈{−0.10,+0.05,+0.10,+0.20}，k∈{10,20,50}）时，variogram 随 |α| 在扩张与收缩两个方向都单调恶化（0.0586→0.0696），mmd_u 平坦或更差，neighborhood_mmd 同步恶化（0.11445→0.11572），说明 identity 在该扰动族下是局部最优，不要再用更小 |α| 试探同族配置。

分析员结论：copy_last 基座上，坐标-15NN 表达配对已近局部最优：加 α=0.02 全局位移后再跑 2-opt，3 轮扫描只找到 75/497 对精确增益>EPS 的改善交换、Dirichlet 能量只降 0.313%、neighborhood_mmd 变化≈0，说明'微小表达位移可打破配对局部最优'的前提不成立，与节点 10 在纯 copy_last 上的结论一致。

分析员结论：在 occupancy_dice 评分器已内部做质心归零+主轴对齐+4 种 det=+1 翻转取最优的条件下，提交前对坐标做任何 det=+1 刚体规范化都是 score-wise 恒等变换（本节点 on 态八项 skill 全部=地板 0.5，榜分 50.00）。

分析员结论：在心脏外推榜上，视图内相邻两阶段做型内 OT 配对得到的逐细胞速度，其型内单细胞离散分量 ≥ 系统时间分量（型均速度模长仅 ≈ med_cos×|v| ≈ 8–16 vs |v| 中位 25.6），沿此速度做加法位移注入的是噪声而非发育方向。

分析员结论：在稀疏表达上，父节点加法位移 88.7% 条目被 clip 到 0 的整流偏置是结构性问题而非信号缺失：改成乘法位移 x'=x*2^(alpha*v_t) 后 clip_frac=0、spearman(dp,dt_approx) 从 0.073 升到 0.595，零值保持零、稀疏模式逐位保留。

审查意见 通过 检查1 越界读取：run.py 仅通过 load_manifest/panel_genes/read_stage（第95-97、113行）访问 args.data 视图目录，读取的阶段条目均来自 manifest（anchor_entry、extrap_step），无绝对路径/..//mnt//home/data/raw/downloads/打分器/src/common/evaluation 访问，未联网，未读取目标阶段文件；未发现问题