Virtual Embryo Challenge更新于 10-03 20:28(北京时间) / 每 5 分钟更新

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节点 n1 在终选来历上

seed copy_last

运行?一次完整的自动搜索或 Agent 会话,有自己的锁定配置和证据包。20261002-204524-search-t2-heart-extrap-g24q
父节点(种子,没有父节点)
子节点n3、n4、n5
操作?种子:人写的起点;改进:在父节点上改;草稿:从头写;修复:修父节点的报错。种子
状态已打分
分数搜索目标分 50.00 · proxy 50.00 · 3 次复测均分 50.00
审查通过 seed (human-written, locked)
用时?从运行开始到结束(或到现在)的挂钟时间。不到 1 分
程序版本1aa6ce4e2a6ea32faf14bad30a690214df14864c (programs.git)

方法说明?节点程序自带的 METHOD.md:这个程序做了什么、为什么。

没有 METHOD.md。

调研员的计划

名称seed copy_last
做法seed copy_last: 输出最新输入阶段(proxy:E8.75,24,826 个细胞,在上限 25,179 内,整份原样;final:E9.5,53,742 个,按细胞类型分层抽到 25,179),表达和坐标原样。这就是方法卡提交用的 dam

代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别:绿色是新增,红色是删除。

对比:这个提交的上一版(种子程序:相对空仓库)。改动的文件:solution/README.md +4 −0、solution/run.py +40 −0

diff --git a/solution/README.md b/solution/README.mdnew file mode 100644index 0000000..0071f61--- /dev/null+++ b/solution/README.md@@ -0,0 +1,4 @@+# copy_last(T2:heart:val_extrap)++输出最新输入阶段(proxy:E8.75,24,826 个细胞,在上限 25,179 内,整份原样;final:E9.5,53,742 个,按细胞类型分层抽到 25,179),表达和坐标原样。这就是方法卡提交用的 damped_shift α=β=0。+proxy 预期 50.00(seed 0 实测 50.00,四组均 50,与地板逐位相同)。final 与 `data/processed/t2/T2__heart__val_extrap__damped_shift.h5ad` 抽中同一批细胞(行已排序;那份文件把坐标再缩放到整份 E9.5 的 RMS 335.0,这里是子集原值 334.9)。diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pynew file mode 100644index 0000000..0595dc9--- /dev/null+++ b/solution/run.py@@ -0,0 +1,40 @@+#!/usr/bin/env python3+"""copy_last (T2): the latest input at or before the target, with its own coordinates.++Interpolation boards take the lower bracket stage, extrapolation boards the+last input; this is the floor's reference stage on the proxy. Cells are drawn+stratified by cell type only when the stage exceeds the board's max_cells.+Expression and coordinates are unchanged.+"""++from __future__ import annotations++import argparse++import numpy as np++from src.task2_spatial.sample import take+from src.task2_spatial.view_io import anchor_entry, load_manifest, panel_genes, read_stage, write_t2+++def main() -> None:+    parser = argparse.ArgumentParser()+    parser.add_argument("--data", required=True)+    parser.add_argument("--out", required=True)+    parser.add_argument("--seed", type=int, default=0)+    args = parser.parse_args()++    manifest = load_manifest(args.data)+    genes = panel_genes(args.data, manifest)+    stage = read_stage(args.data, anchor_entry(manifest), genes)+    n = int(np.clip(stage.n, manifest["min_cells"], manifest["max_cells"]))+    rng = np.random.default_rng(args.seed)+    if n <= stage.n:+        rows = np.sort(take(stage.labels, n, rng))+    else:  # fewer cells than min_cells: resample with replacement+        rows = np.sort(rng.choice(stage.n, size=n, replace=True))+    write_t2(args.out, stage.X[rows].toarray(), stage.coords[rows], genes, seed=args.seed)+++if __name__ == "__main__":+    main()

调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果(只列标题和编号)。

没有记录调研来源。

分析结果?分析员写的 ANALYSIS.json:改了什么、各组分数怎么变、假设是否成立、经验和下一步建议。

没有分析结果(ANALYSIS.json)。

对话摘要?每个角色和大模型对话的统计:轮数、工具调用、用时、token 数和最后的回答摘录;原始记录只给路径。

只给统计和最后回答的摘录;完整对话请到原始记录位置?完整对话记录在 Spark 上的文件路径;看板不复制原始内容。里列出的文件看。

这个节点没有大模型对话记录。