Virtual Embryo Challenge更新于 10-03 21:24（北京时间） / 每 5 分钟更新

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节点 n14

copy_last, expression x0.97 (fake Engineer, node 14)

运行?一次完整的自动搜索或 Agent 会话，有自己的锁定配置和证据包。20261002-230901-search-t2-g24-fake-D
父节点n3
子节点n15、n18
操作?种子：人写的起点；改进：在父节点上改；草稿：从头写；修复：修父节点的报错。改进
状态格式不合格
分数没有分数
审查未审查
用时?从运行开始到结束（或到现在）的挂钟时间。不到 1 分
程序版本20444bf4f0fc3bd069861d50e5b8664484cac813 （programs.git）
备注invalid_format:

方法说明?节点程序自带的 METHOD.md：这个程序做了什么、为什么。

来自 programs.git 20444bf4f0:solution/METHOD.md

copy_last, expression x0.97 (fake Engineer, node 14)

Test run only.

调研员的计划

名称fake-plan-14
动机test node 14; idea improve
做法perturb the heart / edge weights of the parent's reweighting
风险none (fake)

代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别：绿色是新增，红色是删除。

对比：父节点版本 a74013cffc。改动的文件：solution/METHOD.md +1 −1、solution/run.py +3 −3

diff --git a/solution/METHOD.md b/solution/METHOD.mdindex b994aec..f13d8aa 100644--- a/solution/METHOD.md+++ b/solution/METHOD.md@@ -1,3 +1,3 @@-copy_last, expression x0.99 (fake Engineer, node 3)+copy_last, expression x0.97 (fake Engineer, node 14)  Test run only.diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pyindex 480930e..b1b4cd4 100644--- a/solution/run.py+++ b/solution/run.py@@ -1,5 +1,5 @@ #!/usr/bin/env python3-"""fake-3: copy_last with expression scaled x0.99 (fake Engineer, T2 test run)."""+"""fake-14: copy_last with expression scaled x0.97 (fake Engineer, T2 test run)."""  from __future__ import annotations @@ -10,7 +10,7 @@ import numpy as np from src.task2_spatial.sample import take from src.task2_spatial.view_io import anchor_entry, load_manifest, panel_genes, read_stage, write_t2 -SCALE = 0.99+SCALE = 0.97   def main() -> None:@@ -27,7 +27,7 @@ def main() -> None:     rng = np.random.default_rng(args.seed)     rows = np.sort(take(stage.labels, n, rng)) if n <= stage.n else np.sort(rng.choice(stage.n, size=n, replace=True))     X = stage.X[rows].toarray() * SCALE-    write_t2(args.out, X, stage.coords[rows], genes, seed=args.seed)+    write_t2(args.out, X[:10], stage.coords[rows][:10], genes, seed=args.seed)   if __name__ == "__main__":

调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果（只列标题和编号）。

用到的知识库条目

编号标题出处
k003Fused Gromov-Wasserstein mapping for spatial snapshots10.1038/s41586-024-08453-2
k016Degenerate-solution checks for population predictionsnotes/handover/02_知识学习路线.md
k026Canonicalise predicted 3D coordinates before submissionnotes/pitfalls/04_scorer_invariance.md

分析结果?分析员写的 ANALYSIS.json：改了什么、各组分数怎么变、假设是否成立、经验和下一步建议。

改了什么heart / edge weights
各组分数的变化cell_state：None
expression_change：None
local_spatial：None
shape_scale：None
失败原因status invalid_format
family_idother
假设是否成立unclear
经验
  1. node 14: d_score None
mechanism_activeunclear
下一步建议
  1. try another weight

对话摘要?每个角色和大模型对话的统计：轮数、工具调用、用时、token 数和最后的回答摘录；原始记录只给路径。

只给统计和最后回答的摘录；完整对话请到原始记录位置里列出的文件看。

分析员

角色?调研员写计划、工程师改代码、分析员解读分数、审查员检查作弊。分析员 fake
调用次数1 次
轮数?大模型一共回复了几轮（每轮可以调用多个工具）。1
工具调用?大模型调用读文件、执行命令等工具的次数，按工具名统计。共 0 次：—
用时不到 1 分
token 数?输入 / 输出（含思考）的 token 数，来自接口返回的用量。输入 21 · 输出 5 · 思考 0
任务（第一行）分析节点 n14 的打分结果，写 ANALYSIS.json
最后的回答（摘录）
ANALYSIS.json written
原始记录位置?完整对话记录在 Spark 上的文件路径；看板不复制原始内容。/home/spark-longxinyang/vec/runs/test/20261002-230901-search-t2-g24-fake-D/nodes/14/analyst.jsonl 1 KB
/home/spark-longxinyang/vec/runs/test/20261002-230901-search-t2-g24-fake-D/nodes/14/analyst.stderr

工程师

角色工程师 fake
调用次数1 次
轮数1
工具调用共 0 次：—
用时不到 1 分
token 数输入 58 · 输出 14 · 思考 0
任务（第一行）按计划修改程序：fake-plan-14
最后的回答（摘录）
wrote solution/run.py with heart x2.0, edge x0.1 (invalid)
原始记录位置/home/spark-longxinyang/vec/runs/test/20261002-230901-search-t2-g24-fake-D/nodes/14/engineer.jsonl 1 KB
/home/spark-longxinyang/vec/runs/test/20261002-230901-search-t2-g24-fake-D/nodes/14/engineer.stderr

调研员

角色调研员 fake
调用次数1 次
轮数1
工具调用共 0 次：—
用时不到 1 分
token 数输入 17 · 输出 4 · 思考 0
任务（第一行）为节点 n14（改进，父节点 n3）写改进计划 PLAN.json
最后的回答（摘录）
PLAN.json written
原始记录位置/home/spark-longxinyang/vec/runs/test/20261002-230901-search-t2-g24-fake-D/nodes/14/researcher.jsonl 0 KB
/home/spark-longxinyang/vec/runs/test/20261002-230901-search-t2-g24-fake-D/nodes/14/researcher.stderr