总览 · ← 返回运行 20261001-164851-search-t1-g29-fake
节点 n54
heart_jcf_peri reweighting, heart x1.2, edge x0.3 (fake Engineer, node 54)
| 运行?一次完整的自动搜索或 Agent 会话,有自己的锁定配置和证据包。 | 20261001-164851-search-t1-g29-fake |
|---|---|
| 父节点 | (种子,没有父节点) |
| 子节点 | — |
| 操作?种子:人写的起点;改进:在父节点上改;草稿:从头写;修复:修父节点的报错。 | 草稿 |
| 状态 | 格式不合格 |
| 分数 | 没有分数 |
| 审查 | 未审查 |
| 用时?从运行开始到结束(或到现在)的挂钟时间。 | 不到 1 分 |
| 程序版本 | 2fb3120151bdf14b983bbb5db31fded350b14ef8 (programs.git) |
| 备注 | invalid_format on X3: |
方法说明?节点程序自带的 METHOD.md:这个程序做了什么、为什么。
来自 programs.git 2fb3120151:solution/METHOD.md
heart_jcf_peri reweighting, heart x1.2, edge x0.3 (fake Engineer, node 54)
Test run only.
调研员的计划
| 名称 | fake-plan-54 |
|---|---|
| 动机 | test node 54; idea T1-04 |
| 做法 | perturb the heart / edge weights of the parent's reweighting |
| 风险 | none (fake) |
代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别:绿色是新增,红色是删除。
对比:这个提交的上一版(种子程序:相对空仓库)。改动的文件:solution/METHOD.md +3 −0、solution/run.py +40 −0
diff --git a/solution/METHOD.md b/solution/METHOD.mdnew file mode 100644index 0000000..2598344--- /dev/null+++ b/solution/METHOD.md@@ -0,0 +1,3 @@+heart_jcf_peri reweighting, heart x1.2, edge x0.3 (fake Engineer, node 54)++Test run only.diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pynew file mode 100644index 0000000..7fd890a--- /dev/null+++ b/solution/run.py@@ -0,0 +1,40 @@+#!/usr/bin/env python3+"""fake-54: heart_jcf_peri weights perturbed by the fake Engineer (test run)."""++from __future__ import annotations++import argparse++from src.task1_temporal.reweight import heart_reweight+from src.task1_temporal.view_io import (+ inputs_by_time,+ labels_of,+ load_manifest,+ panel_genes,+ read_stage,+ target_n_cells,+ write_prediction,+)++HEART_WEIGHT = 1.2+EDGE_WEIGHT = 0.3+N_CELLS = 4000+++def main() -> None:+ parser = argparse.ArgumentParser()+ parser.add_argument("--data", required=True)+ parser.add_argument("--out", required=True)+ parser.add_argument("--seed", type=int, default=0)+ args = parser.parse_args()+ manifest = load_manifest(args.data)+ genes = panel_genes(args.data, manifest)+ last = read_stage(args.data, inputs_by_time(manifest)[-1], genes)+ pass+ n = target_n_cells(manifest, N_CELLS)+ X = heart_reweight(last.X, labels_of(last), n_cells=n, heart_weight=HEART_WEIGHT, edge_weight=EDGE_WEIGHT, seed=args.seed)+ write_prediction(X[:10], genes, args.out, seed=args.seed)+++if __name__ == "__main__":+ main()
调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果(只列标题和编号)。
用到的知识库条目
| 编号 | 标题 | 出处 |
|---|---|---|
| k031 | Offline OT toolkit in the sandbox: moscot TemporalProblem, wot OTModel, POT, geomloss | 10.1038/s41586-024-08453-2 (moscot); 10.1016/j.cell.2019.01.006 (Waddington-OT) |
| k004 | Our OT recipe on the released T1 stages (census) | notes/competition/09_t1_census_lineage.md |
| k002 | moscot.time: scalable temporal OT with growth rates and low-rank solvers | 10.1038/s41586-024-08453-2 |
分析结果?分析员写的 ANALYSIS.json:改了什么、各组分数怎么变、假设是否成立、经验和下一步建议。
| 改了什么 | heart / edge weights |
|---|---|
| 各组分数的变化 | cell_state:None covariation:None de_recovery:None direction:None |
| 失败原因 | status invalid_format |
| 假设是否成立 | unclear |
| 经验 |
|
| 下一步建议 |
|
对话摘要?每个角色和大模型对话的统计:轮数、工具调用、用时、token 数和最后的回答摘录;原始记录只给路径。
只给统计和最后回答的摘录;完整对话请到原始记录位置里列出的文件看。
分析员
| 角色?调研员写计划、工程师改代码、分析员解读分数、审查员检查作弊。 | 分析员 fake |
|---|---|
| 调用次数 | 1 次 |
| 轮数?大模型一共回复了几轮(每轮可以调用多个工具)。 | 1 |
| 工具调用?大模型调用读文件、执行命令等工具的次数,按工具名统计。 | 共 0 次:— |
| 用时 | 不到 1 分 |
| token 数?输入 / 输出(含思考)的 token 数,来自接口返回的用量。 | 输入 21 · 输出 5 · 思考 0 |
| 任务(第一行) | 分析节点 n54 的打分结果,写 ANALYSIS.json |
| 最后的回答(摘录) | ANALYSIS.json written |
| 原始记录位置?完整对话记录在 Spark 上的文件路径;看板不复制原始内容。 | /home/spark-longxinyang/vec/g29_wt/agent/runs/20261001-164851-search-t1-g29-fake/nodes/54/analyst.jsonl 1 KB /home/spark-longxinyang/vec/g29_wt/agent/runs/20261001-164851-search-t1-g29-fake/nodes/54/analyst.stderr |
工程师
| 角色 | 工程师 fake |
|---|---|
| 调用次数 | 1 次 |
| 轮数 | 1 |
| 工具调用 | 共 0 次:— |
| 用时 | 不到 1 分 |
| token 数 | 输入 58 · 输出 14 · 思考 0 |
| 任务(第一行) | 按计划修改程序:fake-plan-54 |
| 最后的回答(摘录) | wrote solution/run.py with heart x1.2, edge x0.3 (invalid) |
| 原始记录位置 | /home/spark-longxinyang/vec/g29_wt/agent/runs/20261001-164851-search-t1-g29-fake/nodes/54/engineer.jsonl 1 KB /home/spark-longxinyang/vec/g29_wt/agent/runs/20261001-164851-search-t1-g29-fake/nodes/54/engineer.stderr |
调研员
| 角色 | 调研员 fake |
|---|---|
| 调用次数 | 1 次 |
| 轮数 | 1 |
| 工具调用 | 共 0 次:— |
| 用时 | 不到 1 分 |
| token 数 | 输入 17 · 输出 4 · 思考 0 |
| 任务(第一行) | 为节点 n54(草稿,父节点 nNone)写改进计划 PLAN.json,思路 T1-04 |
| 最后的回答(摘录) | PLAN.json written |
| 原始记录位置 | /home/spark-longxinyang/vec/g29_wt/agent/runs/20261001-164851-search-t1-g29-fake/nodes/54/researcher.jsonl 0 KB /home/spark-longxinyang/vec/g29_wt/agent/runs/20261001-164851-search-t1-g29-fake/nodes/54/researcher.stderr |