Virtual Embryo Challenge更新于 10-03 21:24(北京时间) / 每 5 分钟更新

总览 · ← 返回运行 20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup

节点 n73

heart_jcf_peri reweighting, heart x1.9, edge x0.15 (fake Engineer, node 73)

运行?一次完整的自动搜索或 Agent 会话,有自己的锁定配置和证据包。20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup
父节点n70
子节点—
操作?种子:人写的起点;改进:在父节点上改;草稿:从头写;修复:修父节点的报错。修复
状态已打分
分数搜索目标分 43.39 · proxy 55.91 · proxy2 27.43 · X3 46.85
审查未审查
用时?从运行开始到结束(或到现在)的挂钟时间。不到 1 分
程序版本e1b296db05d338060e7ff6708822b203a3c5d882 (programs.git)

方法说明?节点程序自带的 METHOD.md:这个程序做了什么、为什么。

来自 programs.git e1b296db05:solution/METHOD.md

heart_jcf_peri reweighting, heart x1.9, edge x0.15 (fake Engineer, node 73)

Test run only.

调研员的计划

名称fake-plan-73
动机test node 73; idea improve
做法perturb the heart / edge weights of the parent's reweighting
风险none (fake)

代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别:绿色是新增,红色是删除。

对比:父节点版本 6a3d1593df。改动的文件:solution/METHOD.md +1 −1、solution/run.py +4 −4

diff --git a/solution/METHOD.md b/solution/METHOD.mdindex 1c41355..691da71 100644--- a/solution/METHOD.md+++ b/solution/METHOD.md@@ -1,3 +1,3 @@-heart_jcf_peri reweighting, heart x1.6, edge x0.1 (fake Engineer, node 70)+heart_jcf_peri reweighting, heart x1.9, edge x0.15 (fake Engineer, node 73)  Test run only.diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pyindex e2351a3..ba983d8 100644--- a/solution/run.py+++ b/solution/run.py@@ -1,5 +1,5 @@ #!/usr/bin/env python3-"""fake-70: heart_jcf_peri weights perturbed by the fake Engineer (test run)."""+"""fake-73: heart_jcf_peri weights perturbed by the fake Engineer (test run)."""  from __future__ import annotations @@ -16,8 +16,8 @@ from src.task1_temporal.view_io import (     write_prediction, ) -HEART_WEIGHT = 1.6-EDGE_WEIGHT = 0.1+HEART_WEIGHT = 1.9+EDGE_WEIGHT = 0.15 N_CELLS = 4000  @@ -33,7 +33,7 @@ def main() -> None:     pass     n = target_n_cells(manifest, N_CELLS)     X = heart_reweight(last.X, labels_of(last), n_cells=n, heart_weight=HEART_WEIGHT, edge_weight=EDGE_WEIGHT, seed=args.seed)-    write_prediction(X[:10], genes, args.out, seed=args.seed)+    write_prediction(X, genes, args.out, seed=args.seed)   if __name__ == "__main__":

调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果(只列标题和编号)。

用到的知识库条目

编号标题出处
k005PAGA: graph abstraction for cluster connectivity10.1186/s13059-019-1663-x
k012Official T1 scoring, output contract and adversarial controlsnotes/来件/virtualembryo.ai/task1-temporal.md; notes/来件/virtualembryo.ai/baselines.md
k056Cardiac conduction system precursors: SAN (Hcn4, Tbx3, Shox2, Isl1), AVN (Tbx3), ventricular conduction (Gja5, Irx3) from trabeculae10.1161/circresaha.113.301588 (Liang 2013); 10.1161/CIRCRESAHA.118.314578 (Goodyer 2019); 10.1161/CIRCEP.108.829341 (Christoffels and Moorman 2009)

分析结果?分析员写的 ANALYSIS.json:改了什么、各组分数怎么变、假设是否成立、经验和下一步建议。

改了什么heart / edge weights
各组分数的变化cell_state:None
covariation:None
de_recovery:None
direction:None
假设是否成立unclear
经验
  1. node 73: d_score None
下一步建议
  1. try another weight

对话摘要?每个角色和大模型对话的统计:轮数、工具调用、用时、token 数和最后的回答摘录;原始记录只给路径。

只给统计和最后回答的摘录;完整对话请到原始记录位置里列出的文件看。

分析员

角色?调研员写计划、工程师改代码、分析员解读分数、审查员检查作弊。分析员 fake
调用次数1 次
轮数?大模型一共回复了几轮(每轮可以调用多个工具)。1
工具调用?大模型调用读文件、执行命令等工具的次数,按工具名统计。共 0 次:—
用时不到 1 分
token 数?输入 / 输出(含思考)的 token 数,来自接口返回的用量。输入 21 · 输出 5 · 思考 0
任务(第一行)分析节点 n73 的打分结果,写 ANALYSIS.json
最后的回答(摘录)
ANALYSIS.json written
原始记录位置?完整对话记录在 Spark 上的文件路径;看板不复制原始内容。/home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup/nodes/73/analyst.jsonl 1 KB
/home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup/nodes/73/analyst.stderr

工程师

角色工程师 fake
调用次数1 次
轮数1
工具调用共 0 次:—
用时不到 1 分
token 数输入 54 · 输出 13 · 思考 0
任务(第一行)按计划修改程序:fake-plan-73
最后的回答(摘录)
wrote solution/run.py with heart x1.9, edge x0.15 (ok)
原始记录位置/home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup/nodes/73/engineer.jsonl 1 KB
/home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup/nodes/73/engineer.stderr

调研员

角色调研员 fake
调用次数1 次
轮数1
工具调用共 0 次:—
用时不到 1 分
token 数输入 17 · 输出 4 · 思考 0
任务(第一行)为节点 n73(修复,父节点 n70)写改进计划 PLAN.json
最后的回答(摘录)
PLAN.json written
原始记录位置/home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup/nodes/73/researcher.jsonl 0 KB
/home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-154036-search-t1-g23-fake-followup/nodes/73/researcher.stderr