总览 · ← 返回运行 20261001-140014-search-t1-g23-fake-cont
节点 n13
heart_jcf_peri reweighting, heart x1.3, edge x0.2 (fake Engineer, node 13)
| 运行?一次完整的自动搜索或 Agent 会话,有自己的锁定配置和证据包。 | 20261001-140014-search-t1-g23-fake-cont |
|---|---|
| 父节点 | n2 |
| 子节点 | — |
| 操作?种子:人写的起点;改进:在父节点上改;草稿:从头写;修复:修父节点的报错。 | 改进 |
| 状态 | 已打分 |
| 分数 | 搜索目标分 52.67(-0.4) · proxy 55.58(-0.7) · proxy2 55.58(-0.7) · X3 46.85(+0.0) · 3 次复测均分 52.83 |
| 审查 | 未审查 |
| 用时?从运行开始到结束(或到现在)的挂钟时间。 | 不到 1 分 |
| 程序版本 | efa9d6fdc54564021405c090897008027d0b373e (programs.git) |
| 导入自 | 20261001-134009-search-t1-g23-fake#13 |
方法说明?节点程序自带的 METHOD.md:这个程序做了什么、为什么。
来自 programs.git efa9d6fdc5:solution/METHOD.md
heart_jcf_peri reweighting, heart x1.3, edge x0.2 (fake Engineer, node 13)
Test run only.
调研员的计划
| 名称 | fake-plan-13 |
|---|---|
| 动机 | test node 13; idea improve |
| 做法 | perturb the heart / edge weights of the parent's reweighting |
| 风险 | none (fake) |
代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别:绿色是新增,红色是删除。
对比:父节点版本 cd04238ecb。改动的文件:solution/METHOD.md +3 −0、solution/README.md +0 −4、solution/run.py +5 −9
diff --git a/solution/METHOD.md b/solution/METHOD.mdnew file mode 100644index 0000000..f08ca82--- /dev/null+++ b/solution/METHOD.md@@ -0,0 +1,3 @@+heart_jcf_peri reweighting, heart x1.3, edge x0.2 (fake Engineer, node 13)++Test run only.diff --git a/solution/README.md b/solution/README.mddeleted file mode 100644index e66c7c3..0000000--- a/solution/README.md+++ /dev/null@@ -1,4 +0,0 @@-# heart_jcf_peri--run2(20260927-172643-grok-t1)的 T1 胜者:对最新输入阶段按细胞类型重加权再抽 4000 个真实细胞,不改表达。丢 Neural Tube;心脏类(CM、内皮/心内膜、SHF/PHM、JCF、心包、心外膜原基)×1.6;表面外胚层、EXEM、轴旁中胚层 ×0.25;其余 ×1。-proxy 预期 55.97(seed 0,与 run2 的预测逐位相同)。final 读 E9.5,类型集合已含 E9.5 的名字(V-CM、Endocardium、BEC、aPHM、pPHM、Proepicardium)。diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pyindex a752b21..518f011 100644--- a/solution/run.py+++ b/solution/run.py@@ -1,11 +1,5 @@ #!/usr/bin/env python3-"""heart_jcf_peri: run2's T1 winner. Reweight the latest input stage by cell type.--Neural Tube dropped; heart types (CM, endothelium/endocardium, SHF/PHM, JCF,-pericardium, proepicardium) x1.6; surface ectoderm, EXEM, paraxial mesoderm-x0.25; everything else x1. 4000 real cells, no expression shift. Proxy reads-E8.5, final reads E9.5; the type set already names both stages' labels.-"""+"""fake-13: heart_jcf_peri weights perturbed by the fake Engineer (test run).""" from __future__ import annotations @@ -22,6 +16,8 @@ from src.task1_temporal.view_io import ( write_prediction, ) +HEART_WEIGHT = 1.3+EDGE_WEIGHT = 0.2 N_CELLS = 4000 @@ -31,12 +27,12 @@ def main() -> None: parser.add_argument("--out", required=True) parser.add_argument("--seed", type=int, default=0) args = parser.parse_args()- manifest = load_manifest(args.data) genes = panel_genes(args.data, manifest) last = read_stage(args.data, inputs_by_time(manifest)[-1], genes)+ pass n = target_n_cells(manifest, N_CELLS)- X = heart_reweight(last.X, labels_of(last), n_cells=n, seed=args.seed)+ X = heart_reweight(last.X, labels_of(last), n_cells=n, heart_weight=HEART_WEIGHT, edge_weight=EDGE_WEIGHT, seed=args.seed) write_prediction(X, genes, args.out, seed=args.seed)
调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果(只列标题和编号)。
用到的知识库条目
| 编号 | 标题 | 出处 |
|---|---|---|
| k047 | Juxta-cardiac field (JCF): a common progenitor pool of epicardium and myocardium | 10.1126/science.abb2986 (Tyser 2021) |
| k044 | Anterior second heart field (aSHF): Isl1+/Fgf10+ pharyngeal mesoderm adds outflow tract and right ventricle | 10.1016/S1534-5807(01)00040-5 (Kelly 2001); 10.1016/S1534-5807(03)00363-0 (Cai 2003); 10.1101/cshperspect.a015750 (Kelly 2014) |
| k046 | Cardiopharyngeal mesoderm (CPM): shared progenitors of head muscles, pharyngeal connective tissue and SHF myocardium | 10.1242/dev.050674 (Lescroart 2010); 10.1242/dev.185256 (Adachi 2020); 10.1038/nature14435 (Diogo 2015) |
分析结果?分析员写的 ANALYSIS.json:改了什么、各组分数怎么变、假设是否成立、经验和下一步建议。
| 改了什么 | heart / edge weights |
|---|---|
| 各组分数的变化 | cell_state:-0.8 covariation:-0.4734 de_recovery:0.0 direction:-0.4066 |
| 假设是否成立 | 否 |
| 经验 |
|
| 下一步建议 |
|
对话摘要?每个角色和大模型对话的统计:轮数、工具调用、用时、token 数和最后的回答摘录;原始记录只给路径。
只给统计和最后回答的摘录;完整对话请到原始记录位置里列出的文件看。
分析员
| 角色?调研员写计划、工程师改代码、分析员解读分数、审查员检查作弊。 | 分析员 fake |
|---|---|
| 调用次数 | 1 次 |
| 轮数?大模型一共回复了几轮(每轮可以调用多个工具)。 | 1 |
| 工具调用?大模型调用读文件、执行命令等工具的次数,按工具名统计。 | 共 0 次:— |
| 用时 | 不到 1 分 |
| token 数?输入 / 输出(含思考)的 token 数,来自接口返回的用量。 | 输入 21 · 输出 5 · 思考 0 |
| 任务(第一行) | 分析节点 n13 的打分结果,写 ANALYSIS.json |
| 最后的回答(摘录) | ANALYSIS.json written |
| 原始记录位置?完整对话记录在 Spark 上的文件路径;看板不复制原始内容。 | /home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-140014-search-t1-g23-fake-cont/nodes/13/analyst.jsonl (文件不在) |
工程师
| 角色 | 工程师 fake |
|---|---|
| 调用次数 | 1 次 |
| 轮数 | 1 |
| 工具调用 | 共 0 次:— |
| 用时 | 不到 1 分 |
| token 数 | 输入 53 · 输出 13 · 思考 0 |
| 任务(第一行) | 按计划修改程序:fake-plan-13 |
| 最后的回答(摘录) | wrote solution/run.py with heart x1.3, edge x0.2 (ok) |
| 原始记录位置 | /home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-140014-search-t1-g23-fake-cont/nodes/13/engineer.jsonl (文件不在) |
调研员
| 角色 | 调研员 fake |
|---|---|
| 调用次数 | 1 次 |
| 轮数 | 1 |
| 工具调用 | 共 0 次:— |
| 用时 | 不到 1 分 |
| token 数 | 输入 17 · 输出 4 · 思考 0 |
| 任务(第一行) | 为节点 n13(改进,父节点 n2)写改进计划 PLAN.json |
| 最后的回答(摘录) | PLAN.json written |
| 原始记录位置 | /home/spark-longxinyang/vec/g23_wt/agent/runs/20261001-140014-search-t1-g23-fake-cont/nodes/13/researcher.jsonl (文件不在) |