节点 n7

.20，本方案与它的本质区别：(a) 保留节点 2 的重加权采样做真实细胞锚，(b) 位移是每类型一个常向量、在 log1p 空间加、加完把每个细胞的文库大小还原到原值——类型内加常数在数学上不改变类型内协方差，covariation 只会因类型间均值结构变化而轻微移动，不会像节点 3 那样塌方；(c) 收缩系数 α≤0.75 且网格搜索。目标：de_recovery 50.21→53+，同时 proxy/proxy2 不低于 56.23、X3 不再恶化（46.85）。",
  "approach": "步骤：1) 完整保留 solution/run.py 的 heart_reweight 采样（4000 真实细胞），只在其输出 X（log1p 或按 write_prediction 约定）后加一步 X' = X + α·D_{t(cell)}，然后逐细胞重缩放回原 counts 总数再写盘（保持 write_prediction 的计数约定，避免节点 3 式的计数空间破坏）。2) 位移向量 D_t 按可用性二选一（Engineer 先看数据目录再定，两条路都在 25 分钟内可实现）：路线 A（视图内 ≥2 个已发布输入阶段，如 final 的 E8.5+E9.5、proxy2 的官方 E8.5 + Qiu E9.0）：对两阶段都存在的同名类型取 D_t = pseudobulk_log(晚) − pseudobulk_log(早)，仅在同一数据集内计算（Qiu 与官方之间不做差分，避免批次混入）；目标阶段新出现、输入无同名类型的细胞（如 Proepicardium、V-CM），按文献库谱系边继承亲本类型的 D：JCF→Proepicardium（k047）、aSHF/pSHF→PHM 与 OFT/RV 心肌（k044、k046），CM 类用心肌自身 D。路线 B（单输入阶段，proxy 的退路，也是 A 中无匹配类型时的兜底）：类型内成熟轴——对心脏类细胞用已发布阶段的定性程序基因打分（祖细胞程序 Isl1/Fgf10/Tbx1 对分化程序 Myl7/Tnnt2/Actc1，来源 k044/k047，均为已发表阶段知识，不含禁窗信息），取该类型内打分上三分位与下三分位的 pseudobulk_log 差作 D_t（即沿快照内伪时间前推）；无已知方向的非心脏类型 D_t=0（退化为父节点行为）。所有 D_t 逐基因 winsorize 到 |D| 的 95 分位，防离群基因。3) 面板缺失基因（X3/Qiu 只有 27,883 基因）：D 只在视图 genes.txt 交集上计算，缺的置 0。4) α 网格 {0.25, 0.5, 0.75}：先 α=0.5、seed 0 查一次 vec-score（A 半）看三把尺子；再对最优邻域 α 用 seed 0/1 各查一次取均值（预算约 10–14 次查询，留 6 次余量）。判据：de_recovery 提升 ≥2 分（噪声水平）且 covariation 相对父节点 52.98 下降 ≤1 分才算数；差距 <2 分时加查一个 seed 再下结论，不轻信单次。",
  "expected_groups": ["de_recovery", "covariation", "direction"],
  "risks": "1) 重蹈节点 3 覆辙（covariation 38.53）：若位移加在 counts 空间、α 过大或 D 含离群基因。Engineer 尽早发现的方法——第一个查询就跑 α=0.25 并先看 covariation 分组分，若比父节点低 >2 分立即检查是否漏了文库大小还原/winsorize，而不是继续调 α。2) 路线 A 跨数据集差分引入 Qiu 批次效应污染 D：硬性规定 D 只在同数据集内算，proxy2 上若 covariation/cell_state 明显低于 proxy 说明批次泄漏。3) 路线 B 的成熟轴方向可能与真实 E8.5→E9.5 变化不一致（快照内伪时间 ≠ 发育时间），导致 de_recovery 不升反降：α=0.25 的小步长限制损失，且 D_t=0 的类型自动退化为父节点，最坏情况约等于父节点分数。4) 预期增益可能接近噪声（T1 约 2 分）：所有 α 比较用 ≥2 个 seed 的 vec-score 均值，且以三把尺子加权均分而非单尺子做选择，避免 A 半过拟合。5) X3 已偏弱（46.85 vs copy_last 50.00），若加位移后 X3 继续掉而 proxy 涨，选使三尺子均分最大的 α，必要时对 X3 视图单独用更小 α（按视图传参，不算硬编码统计量）。",
  "sources": []
}
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