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节点 n105

heart_jcf_peri reweighting, heart x1.8, edge x0.1 (fake Engineer, node 105)

运行?	20261001-122903-search-t1-fake
父节点	n47
子节点	n108、n109、n112、n114、n117、n121
操作?	改进
状态	已打分
分数	搜索目标分 55.91 · proxy 55.91 · proxy2 55.91 · 3 次复测均分 55.72
审查	未审查
用时?	2 分
程序版本	170c941af3cd8a1624a02e1f50c5bc9e5f29a006 （programs.git）
导入自	20261001-112808-search-t1-fake#105
备注	re-scored at launch (origin 20261001-112808-search-t1-fake node 105, score there 55.91)

方法说明?

来自 programs.git 170c941af3:solution/METHOD.md

heart_jcf_peri reweighting, heart x1.8, edge x0.1 (fake Engineer, node 105)

Test run only.

调研员的计划

名称	fake-plan-105
动机	test node 105; idea improve
做法	perturb the heart / edge weights of the parent's reweighting
风险	none (fake)

代码改动?

对比：父节点版本 b41405c48f。改动的文件：solution/METHOD.md +1 −1、solution/run.py +3 −3

diff --git a/solution/METHOD.md b/solution/METHOD.mdindex bc62566..0a5dbe0 100644--- a/solution/METHOD.md+++ b/solution/METHOD.md@@ -1,3 +1,3 @@-heart_jcf_peri reweighting, heart x1.7, edge x0.3 (fake Engineer, node 47)+heart_jcf_peri reweighting, heart x1.8, edge x0.1 (fake Engineer, node 105)  Test run only.diff --git a/solution/run.py b/solution/run.pyindex cfad9e3..d13fd8a 100644--- a/solution/run.py+++ b/solution/run.py@@ -1,5 +1,5 @@ #!/usr/bin/env python3-"""fake-47: heart_jcf_peri weights perturbed by the fake Engineer (test run)."""+"""fake-105: heart_jcf_peri weights perturbed by the fake Engineer (test run)."""  from __future__ import annotations @@ -16,8 +16,8 @@ from src.task1_temporal.view_io import (     write_prediction, ) -HEART_WEIGHT = 1.7-EDGE_WEIGHT = 0.3+HEART_WEIGHT = 1.8+EDGE_WEIGHT = 0.1 N_CELLS = 4000

调研来源?

用到的知识库条目

编号	标题	出处
k005	PAGA: graph abstraction for cluster connectivity	10.1186/s13059-019-1663-x
k037	Lineage-prior generation of new cell types from literature edges and parent cells	notes/competition/05_lineage_graph.md; 06_e95_parent_draft.md; 09_t1_census_lineage.md §4-6; biology entries k043-k063
k012	Official T1 scoring, output contract and adversarial controls	notes/来件/virtualembryo.ai/task1-temporal.md; notes/来件/virtualembryo.ai/baselines.md

计划里引用的来源

arxiv: https://arxiv.org/abs/2409.15080v1 — Integrating Optimal Transport and Structural Inference Models for GRN Inference from Single-cell Data
arxiv: https://arxiv.org/abs/2502.05241v1 — MultistageOT: Multistage optimal transport infers trajectories from a snapshot of single-cell data

分析结果?

改了什么	heart / edge weights
各组分数的变化	cell_state：-0.53 covariation：-0.98 de_recovery：0.0 direction：0.44
假设是否成立	否
经验	node 105: d_score -0.242
下一步建议	try another weight

对话摘要?

只给统计和最后回答的摘录；完整对话请到原始记录位置里列出的文件看。

分析员

角色?	分析员 fake
调用次数	1 次
轮数?	1
工具调用?	共 0 次：—
用时	不到 1 分
token 数?	输入 21 · 输出 5 · 思考 0
任务（第一行）	分析节点 n105 的打分结果，写 ANALYSIS.json
最后的回答（摘录）	ANALYSIS.json written
原始记录位置?	/home/spark-longxinyang/vec/g18_wt/agent/runs/20261001-122903-search-t1-fake/nodes/105/analyst.jsonl （文件不在）

工程师

角色	工程师 fake
调用次数	1 次
轮数	1
工具调用	共 5 次：—
用时	1 分
token 数	输入 53 · 输出 13 · 思考 0
任务（第一行）	按计划修改程序：fake-plan-105
最后的回答（摘录）	wrote solution/run.py with heart x1.8, edge x0.1 (ok)
原始记录位置	/home/spark-longxinyang/vec/g18_wt/agent/runs/20261001-122903-search-t1-fake/nodes/105/engineer.jsonl （文件不在）

调研员

角色	调研员 fake
调用次数	1 次
轮数	1
工具调用	共 2 次：—
用时	不到 1 分
token 数	输入 17 · 输出 4 · 思考 0
任务（第一行）	为节点 n105（改进，父节点 n47）写改进计划 PLAN.json
最后的回答（摘录）	PLAN.json written
原始记录位置	/home/spark-longxinyang/vec/g18_wt/agent/runs/20261001-122903-search-t1-fake/nodes/105/researcher.jsonl （文件不在）

节点 n105

方法说明?节点程序自带的 METHOD.md：这个程序做了什么、为什么。

调研员的计划

代码改动?这个节点的程序和父节点程序的逐行差别：绿色是新增，红色是删除。

调研来源?调研员查到并用到的知识条目和文献检索结果（只列标题和编号）。